Struktur organisasi sekolah di SMP Negeri 2 Depok disusun untuk mendukung pengelolaan sekolah secara efektif dan terarah. Kepala sekolah berperan sebagai pimpinan utama yang bertanggung jawab atas seluruh kegiatan sekolah. Dalam pelaksanaannya, kepala sekolah dibantu oleh wakil kepala sekolah sesuai bidangnya, seperti bidang kurikulum, kesiswaan, sarana dan prasarana, serta humas. Selain itu, terdapat guru, wali kelas, tenaga kependidikan, serta berbagai tim dan koordinator kegiatan yang bekerja sama untuk mendukung proses pembelajaran dan pengembangan peserta didik secara optimal.

Berikut ini Bagan Struktur Organisasi SMP Negeri 2 Depok Tahun 2026